More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0102 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 559 aa  1140    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  40.79 
 
 		 542 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  39.88 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  36.16 
 
 		 542 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  39.25 
 
 		 536 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  37.23 
 
 		 528 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  39.04 
 
 		 530 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  38.22 
 
 		 534 aa  339  7e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  40.82 
 
 		 537 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  36.67 
 
 		 531 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  37.33 
 
 		 539 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  39.18 
 
 		 536 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.7 
 
 		 550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  35.88 
 
 		 536 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  37.7 
 
 		 534 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.23 
 
 		 567 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.17 
 
 		 614 aa  310  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.45 
 
 		 609 aa  309  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.06 
 
 		 597 aa  309  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.85 
 
 		 610 aa  307  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.85 
 
 		 610 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.38 
 
 		 575 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.13 
 
 		 607 aa  306  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  35.24 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  34.48 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  34.8 
 
 		 617 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.42 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  33.39 
 
 		 614 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  33.78 
 
 		 616 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  33.79 
 
 		 604 aa  300  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  33.83 
 
 		 605 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.3 
 
 		 597 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.79 
 
 		 560 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  34.47 
 
 		 592 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.61 
 
 		 560 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  33.39 
 
 		 616 aa  296  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.44 
 
 		 609 aa  296  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  33.06 
 
 		 624 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.24 
 
 		 632 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.25 
 
 		 560 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  33 
 
 		 616 aa  292  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  34.59 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.07 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.39 
 
 		 635 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.93 
 
 		 563 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 		 578 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  39.85 
 
 		 556 aa  290  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.36 
 
 		 545 aa  289  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 		 578 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.1 
 
 		 560 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  34.81 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  33.73 
 
 		 609 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  33.11 
 
 		 589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  34.32 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.39 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.77 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  31.97 
 
 		 570 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.93 
 
 		 621 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  33.74 
 
 		 550 aa  283  7.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.63 
 
 		 620 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.2 
 
 		 554 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.8 
 
 		 554 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.11 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  32.44 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.25 
 
 		 553 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  33.4 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  37.13 
 
 		 556 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.55 
 
 		 622 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.4 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.01 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  37.03 
 
 		 556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  32.57 
 
 		 552 aa  269  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.34 
 
 		 552 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 612 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  31.47 
 
 		 528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  31.47 
 
 		 528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.48 
 
 		 577 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.42 
 
 		 567 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  33.69 
 
 		 562 aa  266  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.97 
 
 		 555 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.38 
 
 		 623 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.33 
 
 		 584 aa  266  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.55 
 
 		 623 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.44 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.28 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.5 
 
 		 555 aa  263  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.39 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.39 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.39 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.39 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.39 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.39 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.39 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.48 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.33 
 
 		 541 aa  259  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.28 
 
 		 541 aa  259  9e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.92 
 
 		 553 aa  259  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.57 
 
 		 557 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 		 628 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>