More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2030 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  63.07 
 
 
584 aa  747    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  62.63 
 
 
587 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  71.81 
 
 
583 aa  829    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  72.01 
 
 
579 aa  848    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  69.11 
 
 
585 aa  823    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  100 
 
 
584 aa  1203    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  74.49 
 
 
583 aa  899    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  38.97 
 
 
607 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.03 
 
 
621 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.27 
 
 
596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  31.41 
 
 
617 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.1 
 
 
602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.68 
 
 
620 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.69 
 
 
622 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.04 
 
 
621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31.86 
 
 
542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  29.95 
 
 
600 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.74 
 
 
636 aa  227  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.45 
 
 
542 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  30.97 
 
 
559 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.31 
 
 
528 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  28.14 
 
 
553 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.87 
 
 
575 aa  196  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  27.54 
 
 
557 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.06 
 
 
557 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  29.64 
 
 
530 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.64 
 
 
627 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  31.21 
 
 
536 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  27.07 
 
 
556 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.09 
 
 
536 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.38 
 
 
582 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  29.06 
 
 
545 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  26.61 
 
 
551 aa  189  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  28.22 
 
 
547 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  28.94 
 
 
552 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.6 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.28 
 
 
578 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.28 
 
 
578 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.32 
 
 
552 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.64 
 
 
554 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.85 
 
 
560 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.84 
 
 
560 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  28.91 
 
 
559 aa  183  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.5 
 
 
560 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.45 
 
 
554 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  28.37 
 
 
541 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  28.01 
 
 
541 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  28.24 
 
 
531 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
545 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  28.37 
 
 
541 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.62 
 
 
550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  28.12 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  28.12 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.48 
 
 
567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  30.23 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.12 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  28.12 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.19 
 
 
560 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.17 
 
 
541 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 
581 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.14 
 
 
552 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.82 
 
 
560 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  28.01 
 
 
541 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.88 
 
 
555 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.65 
 
 
540 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.1 
 
 
555 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  27.37 
 
 
557 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  27.86 
 
 
583 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.2 
 
 
553 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  27.08 
 
 
562 aa  177  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  26.65 
 
 
542 aa  177  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  27.51 
 
 
549 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.24 
 
 
557 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  27.15 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
558 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
558 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
558 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.29 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  28.86 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.29 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  28.86 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  29.88 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  29.52 
 
 
562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  29.51 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  28.35 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.4 
 
 
555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.11 
 
 
541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  26.92 
 
 
592 aa  174  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.38 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.39 
 
 
545 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  27.23 
 
 
540 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.37 
 
 
623 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.37 
 
 
623 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.77 
 
 
566 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  33.84 
 
 
546 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>