More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2014 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 		 621 aa  1269    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.2 
 
 		 602 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.58 
 
 		 596 aa  478  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.6 
 
 		 620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  35.06 
 
 		 617 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  36.03 
 
 		 600 aa  360  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.84 
 
 		 621 aa  327  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.61 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.31 
 
 		 627 aa  306  7e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.39 
 
 		 636 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  32.09 
 
 		 587 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  31.75 
 
 		 584 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  32.1 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.45 
 
 		 583 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  31.76 
 
 		 585 aa  272  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  30.91 
 
 		 579 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  30.85 
 
 		 583 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  29.8 
 
 		 607 aa  236  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  28.1 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  27.73 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  27.72 
 
 		 537 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  29.24 
 
 		 547 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.72 
 
 		 543 aa  178  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.18 
 
 		 559 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.11 
 
 		 575 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.81 
 
 		 543 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.33 
 
 		 544 aa  174  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.53 
 
 		 541 aa  173  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  26.87 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.57 
 
 		 543 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 		 540 aa  170  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  24.1 
 
 		 528 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.55 
 
 		 557 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  25.86 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.94 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.94 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.94 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.94 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.61 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.78 
 
 		 545 aa  167  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 548 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  27.25 
 
 		 539 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.58 
 
 		 565 aa  166  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.41 
 
 		 554 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.11 
 
 		 541 aa  166  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  28.23 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.2 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  28.43 
 
 		 536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  26.27 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.97 
 
 		 554 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.03 
 
 		 550 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  26.4 
 
 		 531 aa  163  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.04 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.71 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  26.34 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.08 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.34 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.34 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.34 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.29 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.34 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.34 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.22 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.15 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.26 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.29 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.29 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.69 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.91 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.91 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.29 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.28 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.91 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  27.42 
 
 		 545 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.11 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.54 
 
 		 567 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.16 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  24.26 
 
 		 616 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.8 
 
 		 555 aa  157  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  24.96 
 
 		 530 aa  157  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  25.29 
 
 		 609 aa  157  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.54 
 
 		 555 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  23.73 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.12 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.74 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.74 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.74 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  26.63 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.74 
 
 		 558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.74 
 
 		 558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  25.31 
 
 		 617 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.74 
 
 		 558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.74 
 
 		 558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.92 
 
 		 560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  25 
 
 		 553 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  24.49 
 
 		 556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.42 
 
 		 635 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>