More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2561 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  75.04 
 
 		 584 aa  863    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  64.04 
 
 		 579 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  63.27 
 
 		 583 aa  756    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  63.16 
 
 		 585 aa  747    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  62.63 
 
 		 584 aa  748    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  66.02 
 
 		 583 aa  754    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 587 aa  1197    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  39.29 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.96 
 
 		 621 aa  296  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  31.24 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.5 
 
 		 596 aa  266  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.32 
 
 		 636 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.52 
 
 		 622 aa  266  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.82 
 
 		 602 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.76 
 
 		 621 aa  248  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  31.43 
 
 		 600 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.21 
 
 		 620 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31.71 
 
 		 542 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.59 
 
 		 627 aa  209  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.88 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.17 
 
 		 542 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.74 
 
 		 559 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.84 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  30.51 
 
 		 530 aa  203  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.13 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.2 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.99 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.01 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  28.38 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  26.24 
 
 		 551 aa  193  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.38 
 
 		 550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  26.95 
 
 		 604 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  28.42 
 
 		 545 aa  191  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.1 
 
 		 537 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.85 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.01 
 
 		 560 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.68 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.73 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.01 
 
 		 560 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.69 
 
 		 578 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 		 534 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  30.89 
 
 		 539 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.01 
 
 		 550 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.76 
 
 		 560 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  27.58 
 
 		 541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.51 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.39 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  28.37 
 
 		 557 aa  183  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  29.8 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.6 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  29.98 
 
 		 559 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.67 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.53 
 
 		 546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.5 
 
 		 557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.41 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.53 
 
 		 546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.53 
 
 		 546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.25 
 
 		 555 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  28.16 
 
 		 552 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  33.42 
 
 		 566 aa  180  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  26.75 
 
 		 542 aa  180  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  26.79 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.32 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.53 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  28.12 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 548 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  34.08 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.88 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.92 
 
 		 518 aa  179  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  28.11 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.32 
 
 		 563 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.84 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 		 555 aa  178  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 548 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  33.33 
 
 		 562 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  27.41 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  28.41 
 
 		 566 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.7 
 
 		 581 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  27.44 
 
 		 548 aa  177  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 548 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.52 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 548 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  32.93 
 
 		 541 aa  177  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 548 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 548 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 548 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 548 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 555 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  27.44 
 
 		 548 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 		 558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 		 558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 		 558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 		 558 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  27.64 
 
 		 543 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  35.2 
 
 		 553 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.94 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>