More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2396 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 582 aa  1193    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.8 
 
 		 544 aa  270  5e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  28.19 
 
 		 585 aa  208  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  28.13 
 
 		 587 aa  206  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  28.38 
 
 		 584 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  27.52 
 
 		 584 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  27.01 
 
 		 583 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.2 
 
 		 787 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  27.68 
 
 		 579 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  26.16 
 
 		 557 aa  183  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.92 
 
 		 553 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.12 
 
 		 553 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  25.81 
 
 		 539 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  27.18 
 
 		 583 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.31 
 
 		 542 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.8 
 
 		 622 aa  180  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  28.12 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  28.23 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  24.58 
 
 		 548 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  26 
 
 		 559 aa  176  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  27.07 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.85 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  26.53 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  26.25 
 
 		 607 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  27.01 
 
 		 536 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  25.62 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  30.52 
 
 		 559 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.67 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  26.48 
 
 		 552 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.82 
 
 		 555 aa  170  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.22 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.63 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  26.3 
 
 		 565 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  25.54 
 
 		 583 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.71 
 
 		 557 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.9 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.17 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  25.67 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.41 
 
 		 555 aa  165  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.8 
 
 		 602 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.58 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  27.22 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.23 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.96 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  27.41 
 
 		 531 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  30.53 
 
 		 628 aa  160  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.05 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.05 
 
 		 548 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 531 aa  160  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.86 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.05 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  25.78 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  25.25 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.91 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  29.23 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  25.91 
 
 		 570 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  24.87 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.36 
 
 		 541 aa  157  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1109  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.09 
 
 		 626 aa  157  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  25.14 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  24.9 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  25.04 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  25.43 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  26.81 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  24.69 
 
 		 541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  26.09 
 
 		 551 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  25.53 
 
 		 545 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.71 
 
 		 554 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  24.87 
 
 		 540 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  24.66 
 
 		 556 aa  154  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  23.61 
 
 		 621 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.51 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  25.62 
 
 		 562 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  24.51 
 
 		 569 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.76 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  24.87 
 
 		 541 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.76 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  29.81 
 
 		 557 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.56 
 
 		 557 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  29 
 
 		 589 aa  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.52 
 
 		 554 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.2 
 
 		 623 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.05 
 
 		 555 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 558 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 558 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 558 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  26.77 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.75 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  24.71 
 
 		 556 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.05 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.6 
 
 		 623 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  27.38 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  24.88 
 
 		 604 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.46 
 
 		 628 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  25 
 
 		 580 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.79 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>