More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1263 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
531 aa  1097    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  32.78 
 
 
536 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.5 
 
 
537 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  35.58 
 
 
536 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  34.84 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  40 
 
 
531 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  37.85 
 
 
528 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.57 
 
 
560 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  35.51 
 
 
542 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  37.7 
 
 
534 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.84 
 
 
560 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.84 
 
 
560 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.42 
 
 
581 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.84 
 
 
560 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.82 
 
 
578 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 
578 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.65 
 
 
575 aa  223  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  44.49 
 
 
536 aa  223  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  34.12 
 
 
562 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.83 
 
 
563 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.94 
 
 
557 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  34.47 
 
 
556 aa  220  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  34.47 
 
 
556 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  31.62 
 
 
539 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.28 
 
 
560 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  27.78 
 
 
542 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  28.6 
 
 
542 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  33.86 
 
 
562 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  29.38 
 
 
541 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  29.38 
 
 
541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  29.38 
 
 
541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  29.38 
 
 
541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  29.11 
 
 
541 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.86 
 
 
541 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.53 
 
 
567 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  29.11 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.48 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  28.32 
 
 
550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  35.39 
 
 
534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  28.93 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  29.88 
 
 
545 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.98 
 
 
554 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.98 
 
 
554 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  29.29 
 
 
541 aa  213  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 
558 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 
558 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 
558 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
552 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 
558 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  30.63 
 
 
543 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
552 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.02 
 
 
541 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.15 
 
 
558 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.15 
 
 
558 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.15 
 
 
558 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.98 
 
 
553 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.39 
 
 
550 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 
553 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  35.44 
 
 
548 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.05 
 
 
557 aa  210  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.9 
 
 
555 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  27.72 
 
 
545 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.43 
 
 
555 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  28.52 
 
 
542 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  27.88 
 
 
543 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 
552 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.62 
 
 
552 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.89 
 
 
550 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  32.87 
 
 
553 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.58 
 
 
517 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  35.43 
 
 
557 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.18 
 
 
541 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.87 
 
 
518 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.38 
 
 
553 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 
566 aa  202  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.7 
 
 
554 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  31.55 
 
 
544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.43 
 
 
554 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.58 
 
 
531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  32 
 
 
570 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.26 
 
 
555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.15 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  37.18 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.59 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  27.16 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  30.73 
 
 
566 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  32.13 
 
 
544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  30.48 
 
 
566 aa  197  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  31.34 
 
 
545 aa  196  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  31.71 
 
 
559 aa  196  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.76 
 
 
532 aa  196  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.05 
 
 
565 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  28.71 
 
 
551 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.17 
 
 
567 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.83 
 
 
532 aa  195  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
540 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  33.77 
 
 
569 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  41.03 
 
 
541 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  30.84 
 
 
566 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>