More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0553 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.53 
 
 
518 aa  697    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  58.27 
 
 
532 aa  649    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.45 
 
 
517 aa  663    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  58.08 
 
 
532 aa  647    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
531 aa  1087    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.74 
 
 
526 aa  630  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.93 
 
 
530 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.75 
 
 
528 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.36 
 
 
530 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.92 
 
 
536 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.87 
 
 
553 aa  276  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.24 
 
 
555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.93 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  33.46 
 
 
530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.31 
 
 
554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.54 
 
 
550 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.34 
 
 
555 aa  270  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.41 
 
 
575 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  35.24 
 
 
557 aa  270  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.72 
 
 
557 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.7 
 
 
552 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.7 
 
 
552 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.7 
 
 
566 aa  265  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.62 
 
 
557 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.97 
 
 
563 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  34.13 
 
 
547 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.77 
 
 
560 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  48.09 
 
 
562 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  47.7 
 
 
545 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.77 
 
 
560 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.56 
 
 
578 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.56 
 
 
578 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.09 
 
 
553 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.09 
 
 
552 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.29 
 
 
553 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.09 
 
 
552 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.37 
 
 
560 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.66 
 
 
560 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  45.64 
 
 
552 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.86 
 
 
554 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.24 
 
 
541 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.79 
 
 
581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.44 
 
 
554 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  38.01 
 
 
536 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.87 
 
 
555 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.23 
 
 
560 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  49.8 
 
 
553 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  32.53 
 
 
528 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.66 
 
 
542 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.64 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  43.53 
 
 
566 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  33.58 
 
 
531 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  50.88 
 
 
537 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  46.59 
 
 
570 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  45.02 
 
 
543 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  32.09 
 
 
569 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
548 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  42.5 
 
 
548 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  31.83 
 
 
541 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  42.5 
 
 
548 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  47.01 
 
 
557 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  30.53 
 
 
542 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.83 
 
 
541 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  31.83 
 
 
541 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
548 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  31.83 
 
 
541 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
548 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
548 aa  251  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
548 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
548 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.5 
 
 
548 aa  251  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  33.13 
 
 
544 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.77 
 
 
548 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  45.38 
 
 
545 aa  250  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.87 
 
 
567 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.77 
 
 
548 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.77 
 
 
548 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.77 
 
 
548 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 
543 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  30.67 
 
 
541 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.77 
 
 
548 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.72 
 
 
543 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.68 
 
 
548 aa  249  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.16 
 
 
544 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.72 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.22 
 
 
541 aa  249  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  30.67 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.16 
 
 
546 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.16 
 
 
546 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  31.24 
 
 
540 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.48 
 
 
541 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.16 
 
 
546 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.74 
 
 
543 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>