More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1254 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
628 aa  1306    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  44.4 
 
 
553 aa  232  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  31.91 
 
 
604 aa  229  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32.67 
 
 
548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  30.39 
 
 
542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  29.87 
 
 
530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  38.28 
 
 
562 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.29 
 
 
563 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.96 
 
 
607 aa  210  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.19 
 
 
541 aa  210  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.54 
 
 
532 aa  210  7e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.79 
 
 
581 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  36.65 
 
 
604 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  35.28 
 
 
547 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.96 
 
 
567 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.3 
 
 
560 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.3 
 
 
560 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.11 
 
 
560 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.3 
 
 
560 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.63 
 
 
560 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.23 
 
 
575 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  34.29 
 
 
542 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  36.3 
 
 
545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  31.13 
 
 
569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.02 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  35.69 
 
 
566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.92 
 
 
531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  35.5 
 
 
551 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.92 
 
 
518 aa  201  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  36.18 
 
 
534 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.07 
 
 
610 aa  200  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.07 
 
 
610 aa  200  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.9 
 
 
555 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
553 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.44 
 
 
554 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  35.86 
 
 
557 aa  200  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.28 
 
 
609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  35.22 
 
 
539 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.82 
 
 
517 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.6 
 
 
540 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  35.73 
 
 
541 aa  198  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
597 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.3 
 
 
555 aa  198  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  35.45 
 
 
541 aa  198  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.55 
 
 
554 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  35.47 
 
 
531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.05 
 
 
545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.22 
 
 
550 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  35.16 
 
 
541 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  35.25 
 
 
534 aa  197  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  37.96 
 
 
600 aa  197  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.69 
 
 
595 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  40.64 
 
 
557 aa  197  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
554 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  34.91 
 
 
614 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  34.76 
 
 
541 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.02 
 
 
530 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  34.76 
 
 
541 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.3 
 
 
557 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  34.76 
 
 
541 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
553 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
552 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  34.76 
 
 
541 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  28.02 
 
 
540 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.12 
 
 
550 aa  196  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  34.87 
 
 
541 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
554 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
552 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  40.98 
 
 
536 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
578 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 
626 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
578 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.62 
 
 
546 aa  195  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
532 aa  194  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.62 
 
 
546 aa  195  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  39.53 
 
 
542 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.62 
 
 
546 aa  195  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  34.5 
 
 
545 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
597 aa  195  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  33.72 
 
 
542 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  38.71 
 
 
541 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  34.58 
 
 
541 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.01 
 
 
541 aa  194  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  35.67 
 
 
570 aa  194  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 
597 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.58 
 
 
544 aa  194  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.55 
 
 
559 aa  194  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
558 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
558 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
558 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.23 
 
 
632 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.74 
 
 
609 aa  193  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.6 
 
 
530 aa  193  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.6 
 
 
528 aa  193  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.01 
 
 
557 aa  193  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
558 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
558 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  37.95 
 
 
528 aa  193  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  40.56 
 
 
544 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  35.04 
 
 
562 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>