More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2921 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  73.76 
 
 		 583 aa  838    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  65.32 
 
 		 584 aa  760    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  74.83 
 
 		 585 aa  885    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  74.35 
 
 		 584 aa  891    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  75.09 
 
 		 579 aa  870    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  64.04 
 
 		 587 aa  746    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 583 aa  1191    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  39.24 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.85 
 
 		 621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 		 596 aa  254  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.76 
 
 		 617 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.93 
 
 		 602 aa  243  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 620 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.71 
 
 		 621 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.77 
 
 		 622 aa  232  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  29.81 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31.67 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.55 
 
 		 636 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.41 
 
 		 553 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  30.15 
 
 		 557 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.52 
 
 		 542 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.43 
 
 		 552 aa  210  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.38 
 
 		 530 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.34 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.34 
 
 		 560 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.85 
 
 		 557 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.43 
 
 		 552 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  31.01 
 
 		 528 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.05 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.36 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.67 
 
 		 559 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.23 
 
 		 578 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.5 
 
 		 536 aa  200  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.16 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.53 
 
 		 550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.41 
 
 		 554 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.84 
 
 		 581 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  27.03 
 
 		 556 aa  196  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.78 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.22 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.86 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.89 
 
 		 547 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  31 
 
 		 536 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.72 
 
 		 537 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.01 
 
 		 563 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  27.09 
 
 		 551 aa  193  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  29.53 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.46 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.46 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.46 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.61 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.61 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.8 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.61 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 		 554 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  27.93 
 
 		 562 aa  190  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.88 
 
 		 555 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.55 
 
 		 543 aa  189  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  29.94 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  28.68 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.63 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.01 
 
 		 582 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.88 
 
 		 555 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  34.18 
 
 		 566 aa  188  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.56 
 
 		 627 aa  188  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  35.69 
 
 		 557 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.22 
 
 		 545 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  32.22 
 
 		 545 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.09 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  28.26 
 
 		 548 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  29.86 
 
 		 546 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.08 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.82 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  31.98 
 
 		 543 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 548 aa  187  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  27.62 
 
 		 543 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  28.08 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  28.08 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.63 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.25 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  28.88 
 
 		 551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.64 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.62 
 
 		 550 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.08 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.75 
 
 		 553 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.08 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  29.06 
 
 		 546 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.14 
 
 		 541 aa  184  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.54 
 
 		 548 aa  184  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  27 
 
 		 545 aa  183  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.76 
 
 		 548 aa  183  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>