More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2335 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  65.25 
 
 		 579 aa  753    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  64.05 
 
 		 583 aa  764    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  63.26 
 
 		 585 aa  757    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  62.94 
 
 		 584 aa  758    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 584 aa  1199    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  75.04 
 
 		 587 aa  858    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  66.9 
 
 		 583 aa  770    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  39.24 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.28 
 
 		 621 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.98 
 
 		 636 aa  254  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.03 
 
 		 617 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.15 
 
 		 622 aa  249  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 		 602 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.64 
 
 		 596 aa  239  9e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.06 
 
 		 620 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  30.63 
 
 		 600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.27 
 
 		 542 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.57 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.64 
 
 		 621 aa  225  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.48 
 
 		 553 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  30.37 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.37 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  28.52 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.98 
 
 		 537 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  27.97 
 
 		 551 aa  206  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  30.22 
 
 		 559 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.24 
 
 		 575 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  27.18 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.43 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.23 
 
 		 554 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.34 
 
 		 528 aa  200  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.04 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.36 
 
 		 550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.3 
 
 		 557 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.05 
 
 		 555 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.16 
 
 		 554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.01 
 
 		 553 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.37 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.83 
 
 		 545 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.93 
 
 		 554 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  28.21 
 
 		 557 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 627 aa  195  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.85 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  28.17 
 
 		 541 aa  194  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.52 
 
 		 582 aa  193  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 558 aa  193  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 558 aa  193  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 558 aa  193  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 558 aa  193  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  28.65 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.35 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  30.83 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.11 
 
 		 544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  28.17 
 
 		 541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  28.17 
 
 		 541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  28.17 
 
 		 541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.69 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.06 
 
 		 555 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  31.05 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  27.82 
 
 		 541 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  29.05 
 
 		 539 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.54 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  28.24 
 
 		 541 aa  187  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.78 
 
 		 566 aa  187  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  31.4 
 
 		 536 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.79 
 
 		 555 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.38 
 
 		 550 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.86 
 
 		 578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.86 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  29.11 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  28.99 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.51 
 
 		 543 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.82 
 
 		 560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  28.16 
 
 		 549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  27.26 
 
 		 541 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.56 
 
 		 560 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  28.84 
 
 		 534 aa  184  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.3 
 
 		 540 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  29.78 
 
 		 559 aa  183  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.49 
 
 		 567 aa  183  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  28.21 
 
 		 540 aa  183  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  28.44 
 
 		 552 aa  183  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  27.54 
 
 		 542 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  27.82 
 
 		 531 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  30.15 
 
 		 545 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.14 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  28.6 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.56 
 
 		 560 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.07 
 
 		 543 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  27.44 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>