More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0237 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
596 aa  1217    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  43 
 
 
621 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.18 
 
 
620 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.87 
 
 
602 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  37.52 
 
 
617 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  35.68 
 
 
600 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.03 
 
 
621 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
622 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.34 
 
 
627 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.27 
 
 
636 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  31.43 
 
 
584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  31.49 
 
 
587 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  30 
 
 
583 aa  263  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  30.61 
 
 
583 aa  257  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  29.13 
 
 
607 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  30.34 
 
 
579 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  29.62 
 
 
585 aa  247  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  30.21 
 
 
584 aa  246  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  26.4 
 
 
536 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.17 
 
 
541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  25.73 
 
 
583 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  25.3 
 
 
542 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.42 
 
 
566 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 
564 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  26.3 
 
 
549 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.23 
 
 
565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  25.72 
 
 
551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  26.32 
 
 
552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.5 
 
 
550 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  24.55 
 
 
553 aa  147  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  25.15 
 
 
537 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.11 
 
 
547 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.4 
 
 
623 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.4 
 
 
623 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  27.73 
 
 
546 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  27.73 
 
 
546 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  24.8 
 
 
592 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.86 
 
 
575 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  23.02 
 
 
542 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.16 
 
 
628 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.84 
 
 
597 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  23.8 
 
 
539 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 
518 aa  144  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  28.33 
 
 
545 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.63 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.65 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.16 
 
 
531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.01 
 
 
517 aa  142  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.29 
 
 
541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.77 
 
 
632 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  32.69 
 
 
552 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  31.64 
 
 
559 aa  140  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.61 
 
 
581 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
607 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.02 
 
 
567 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  29.38 
 
 
543 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.37 
 
 
597 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  29.79 
 
 
628 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  24.51 
 
 
566 aa  139  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.79 
 
 
557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  33.85 
 
 
536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  24.33 
 
 
604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  24.39 
 
 
528 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.38 
 
 
544 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.16 
 
 
543 aa  138  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.98 
 
 
597 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  31.47 
 
 
553 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
548 aa  137  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
548 aa  137  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 
578 aa  137  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.37 
 
 
548 aa  137  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  30.37 
 
 
548 aa  136  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
548 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
548 aa  136  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
548 aa  136  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
548 aa  136  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.07 
 
 
532 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  33.46 
 
 
570 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  29.97 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.17 
 
 
614 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
560 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 
578 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.9 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.42 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  29.84 
 
 
699 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.78 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  29.25 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  28.53 
 
 
605 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  23.46 
 
 
534 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 
620 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  23.65 
 
 
536 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.08 
 
 
629 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.41 
 
 
543 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 
560 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 
560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 
560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 
560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.31 
 
 
552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.67 
 
 
543 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>