More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1710 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
699 aa  1432    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  27.47 
 
 
628 aa  173  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.71 
 
 
609 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.64 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  27.32 
 
 
559 aa  161  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.23 
 
 
597 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.33 
 
 
532 aa  160  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.33 
 
 
597 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.15 
 
 
628 aa  157  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.8 
 
 
532 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.33 
 
 
517 aa  155  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  35 
 
 
787 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.6 
 
 
610 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.6 
 
 
610 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  35.05 
 
 
545 aa  154  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.03 
 
 
597 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.33 
 
 
518 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  26.1 
 
 
542 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.56 
 
 
600 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  35.36 
 
 
544 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.55 
 
 
531 aa  153  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.71 
 
 
554 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  34.81 
 
 
566 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.44 
 
 
544 aa  151  5e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.39 
 
 
541 aa  151  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.79 
 
 
607 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 
554 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  33.92 
 
 
541 aa  150  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  31.79 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  33.68 
 
 
542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  33.71 
 
 
556 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  32.45 
 
 
536 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  24.69 
 
 
585 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  35.25 
 
 
542 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.66 
 
 
622 aa  147  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  35.5 
 
 
544 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  31.76 
 
 
584 aa  147  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  29.06 
 
 
607 aa  147  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  30.74 
 
 
583 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  22.45 
 
 
584 aa  146  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  33.69 
 
 
605 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.91 
 
 
620 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.79 
 
 
553 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  34.04 
 
 
541 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
541 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.21 
 
 
542 aa  145  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
541 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
541 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  30.93 
 
 
566 aa  144  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  33.33 
 
 
541 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  33.68 
 
 
541 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  33.83 
 
 
569 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  23.9 
 
 
528 aa  144  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
554 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  39.63 
 
 
225 aa  144  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
554 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
602 aa  144  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  27.47 
 
 
548 aa  143  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
541 aa  143  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.28 
 
 
623 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.37 
 
 
545 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.28 
 
 
623 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 
550 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.78 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.46 
 
 
575 aa  143  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  34.04 
 
 
541 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  25.97 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.71 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.71 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.39 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.48 
 
 
560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.46 
 
 
557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  31.84 
 
 
587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  23 
 
 
621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.71 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.78 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.71 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.85 
 
 
581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  32.26 
 
 
624 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  33.68 
 
 
541 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
530 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  31.61 
 
 
614 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  30.23 
 
 
583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.44 
 
 
537 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  33.57 
 
 
541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.58 
 
 
621 aa  141  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  36.82 
 
 
543 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.84 
 
 
596 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  31.94 
 
 
616 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  31.94 
 
 
616 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 
557 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  33.98 
 
 
531 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 
553 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>