More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0158 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
621 aa  1277    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.28 
 
 
622 aa  709    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.07 
 
 
636 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.71 
 
 
627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  37.85 
 
 
617 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.86 
 
 
596 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.15 
 
 
621 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  33.39 
 
 
600 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.02 
 
 
602 aa  297  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.89 
 
 
620 aa  290  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  29.73 
 
 
584 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  29.74 
 
 
585 aa  232  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  30.76 
 
 
587 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  29.47 
 
 
607 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  27.71 
 
 
583 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  28.3 
 
 
584 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 
583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  28.62 
 
 
579 aa  199  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.54 
 
 
553 aa  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  32.36 
 
 
601 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  33 
 
 
628 aa  143  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  30.18 
 
 
541 aa  140  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.47 
 
 
531 aa  140  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.61 
 
 
600 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  31.74 
 
 
699 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.14 
 
 
517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  31.07 
 
 
541 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.74 
 
 
518 aa  137  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  26.67 
 
 
542 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  30.74 
 
 
541 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  31.07 
 
 
541 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  30.42 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  30.42 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  30.42 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  30.65 
 
 
600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  25.63 
 
 
531 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.74 
 
 
541 aa  135  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  30.74 
 
 
541 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.87 
 
 
548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  28.08 
 
 
605 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  26.75 
 
 
543 aa  134  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.91 
 
 
541 aa  134  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  31.29 
 
 
541 aa  133  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.01 
 
 
532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.45 
 
 
609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.76 
 
 
623 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.42 
 
 
623 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.76 
 
 
635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.72 
 
 
607 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  31.94 
 
 
545 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.38 
 
 
551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.99 
 
 
532 aa  130  6e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.89 
 
 
575 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  31.04 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.77 
 
 
541 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  31.04 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  31.04 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 
548 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.21 
 
 
553 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.36 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.87 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  30.77 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.65 
 
 
628 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.69 
 
 
787 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  27.76 
 
 
624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 
548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  27.22 
 
 
609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  26.03 
 
 
570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  28.12 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 
610 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.91 
 
 
543 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.12 
 
 
554 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 
610 aa  128  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.62 
 
 
595 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.88 
 
 
554 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  30.87 
 
 
544 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.11 
 
 
555 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.63 
 
 
544 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  26.18 
 
 
559 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.6 
 
 
530 aa  127  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.64 
 
 
597 aa  127  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  26.08 
 
 
566 aa  127  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  27.7 
 
 
616 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  23.91 
 
 
604 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  29.89 
 
 
617 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 
530 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.09 
 
 
528 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.8 
 
 
555 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.59 
 
 
621 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  27.7 
 
 
616 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>