More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2384 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.3 
 
 
622 aa  744    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.81 
 
 
621 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
636 aa  1295    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  37.48 
 
 
617 aa  362  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.74 
 
 
627 aa  354  2.9999999999999997e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  34.62 
 
 
600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.09 
 
 
596 aa  295  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.2 
 
 
621 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.19 
 
 
602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.55 
 
 
620 aa  273  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  32.5 
 
 
587 aa  259  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  31.09 
 
 
584 aa  253  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  29.87 
 
 
585 aa  241  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  29.85 
 
 
584 aa  233  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  29.59 
 
 
579 aa  231  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  28.35 
 
 
607 aa  229  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.85 
 
 
583 aa  224  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  27.55 
 
 
583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.1 
 
 
531 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.14 
 
 
518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 
517 aa  148  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  25.96 
 
 
604 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  25.63 
 
 
545 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  28.09 
 
 
543 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.33 
 
 
532 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.85 
 
 
541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.72 
 
 
530 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  25.3 
 
 
542 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.39 
 
 
530 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  25.44 
 
 
553 aa  138  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.93 
 
 
528 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  27.62 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.68 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  26.08 
 
 
559 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  23.82 
 
 
617 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.73 
 
 
575 aa  134  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  25.58 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  30.19 
 
 
628 aa  133  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.6 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.6 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  25.55 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.6 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  24.25 
 
 
616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  26.94 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  26.82 
 
 
541 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  26.82 
 
 
541 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  26.82 
 
 
541 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  26.82 
 
 
541 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  26.77 
 
 
541 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  30.06 
 
 
543 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  25.68 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  29.11 
 
 
699 aa  130  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  28.07 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.34 
 
 
526 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  26.66 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  33.75 
 
 
601 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  23.85 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.26 
 
 
541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.37 
 
 
579 aa  128  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  23.65 
 
 
614 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  25.45 
 
 
566 aa  128  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.33 
 
 
543 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  24.87 
 
 
541 aa  127  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.73 
 
 
544 aa  127  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  24.23 
 
 
616 aa  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  25.92 
 
 
544 aa  127  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.06 
 
 
543 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  25.45 
 
 
566 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.34 
 
 
579 aa  125  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  23.34 
 
 
605 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.18 
 
 
543 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  23.85 
 
 
624 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 
632 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.46 
 
 
548 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.63 
 
 
557 aa  124  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.43 
 
 
545 aa  124  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  27.66 
 
 
547 aa  123  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  33.74 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  34.87 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  26.29 
 
 
528 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 
584 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.78 
 
 
600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  24.92 
 
 
550 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  27.89 
 
 
544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.04 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  24.85 
 
 
539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.08 
 
 
553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  26.65 
 
 
604 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  120  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.86 
 
 
623 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.41 
 
 
548 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  30.41 
 
 
548 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  26.81 
 
 
536 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>