More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2235 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 300 aa  613  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  58.26 
 
 		 229 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  55.5 
 
 		 223 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  52.97 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  48.17 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  44.14 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.65 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.91 
 
 		 517 aa  158  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.83 
 
 		 567 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  41.59 
 
 		 545 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.36 
 
 		 541 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.62 
 
 		 567 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.16 
 
 		 575 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  41.46 
 
 		 542 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 		 532 aa  153  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  42.7 
 
 		 545 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  38.86 
 
 		 542 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  42.16 
 
 		 544 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  42.7 
 
 		 541 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.58 
 
 		 518 aa  151  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.86 
 
 		 541 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  42.55 
 
 		 544 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  41.58 
 
 		 541 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  39.49 
 
 		 562 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  41.09 
 
 		 541 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  42.78 
 
 		 557 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  38.01 
 
 		 607 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 		 581 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  42.93 
 
 		 550 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 		 540 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.29 
 
 		 553 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  37.44 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  39.47 
 
 		 540 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  41.09 
 
 		 541 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  41.09 
 
 		 541 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.73 
 
 		 531 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  39.27 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  38.39 
 
 		 566 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  40.41 
 
 		 551 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  41.58 
 
 		 541 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  41.58 
 
 		 541 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  39.71 
 
 		 551 aa  149  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  41.58 
 
 		 541 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  41.58 
 
 		 541 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  40.59 
 
 		 541 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.79 
 
 		 554 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.79 
 
 		 554 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.05 
 
 		 560 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.05 
 
 		 560 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.05 
 
 		 560 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  41.09 
 
 		 542 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.05 
 
 		 560 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  42.27 
 
 		 547 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  39.29 
 
 		 536 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  40.11 
 
 		 543 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  42.16 
 
 		 541 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.87 
 
 		 556 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  38.16 
 
 		 539 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.57 
 
 		 560 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  41.79 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.96 
 
 		 530 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 		 541 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 		 530 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  36.07 
 
 		 583 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  38.03 
 
 		 209 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  36.89 
 
 		 545 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.61 
 
 		 550 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  37.19 
 
 		 556 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  37.19 
 
 		 556 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 		 555 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.68 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.47 
 
 		 545 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.1 
 
 		 578 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  39.51 
 
 		 557 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  38.4 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.58 
 
 		 554 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.58 
 
 		 554 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 		 555 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.1 
 
 		 578 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  36.92 
 
 		 552 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.6 
 
 		 528 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.54 
 
 		 548 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  38.54 
 
 		 548 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  38.54 
 
 		 548 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.54 
 
 		 548 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 558 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 558 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 558 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 558 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 558 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 557 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.56 
 
 		 548 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 558 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 		 558 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  36.97 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  41.88 
 
 		 552 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>