More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1472 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
604 aa  1240    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  31.91 
 
 
628 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.15 
 
 
575 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 
550 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.8 
 
 
557 aa  197  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.25 
 
 
517 aa  196  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  27.45 
 
 
570 aa  194  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  28.75 
 
 
545 aa  193  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27 
 
 
560 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.3 
 
 
560 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.3 
 
 
560 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.17 
 
 
553 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.14 
 
 
560 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
518 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.83 
 
 
578 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.51 
 
 
578 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.48 
 
 
545 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.33 
 
 
554 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  29.86 
 
 
569 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.33 
 
 
552 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.79 
 
 
557 aa  187  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.16 
 
 
554 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.5 
 
 
552 aa  187  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
531 aa  186  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.09 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.59 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.59 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.59 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.13 
 
 
559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.04 
 
 
532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.72 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.28 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.28 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.71 
 
 
540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.28 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.28 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.59 
 
 
553 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.74 
 
 
553 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.74 
 
 
552 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.74 
 
 
552 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  33.54 
 
 
556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  27.48 
 
 
569 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  33.54 
 
 
556 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.65 
 
 
555 aa  184  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  31.23 
 
 
557 aa  183  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.41 
 
 
543 aa  183  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  29.5 
 
 
550 aa  183  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  35.41 
 
 
580 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  27.6 
 
 
541 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  27.12 
 
 
587 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  27.6 
 
 
541 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.69 
 
 
543 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  28.19 
 
 
541 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  27.6 
 
 
541 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  27.6 
 
 
541 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  25.85 
 
 
551 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  26.98 
 
 
540 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  38.04 
 
 
536 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.09 
 
 
560 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 
526 aa  180  7e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 
607 aa  180  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.23 
 
 
553 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.75 
 
 
555 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  27.3 
 
 
617 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  27.65 
 
 
541 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.89 
 
 
564 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  33.02 
 
 
559 aa  178  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.75 
 
 
555 aa  178  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.23 
 
 
554 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.7 
 
 
544 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  27.37 
 
 
528 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.59 
 
 
565 aa  177  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  27.37 
 
 
528 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  29.46 
 
 
542 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.59 
 
 
563 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.23 
 
 
554 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  35.07 
 
 
557 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  33.13 
 
 
583 aa  177  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  26.4 
 
 
542 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
543 aa  176  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  35.05 
 
 
541 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  35.05 
 
 
541 aa  176  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  32.8 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  31 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  36.9 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  35.05 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
548 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.88 
 
 
566 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1784  60 kDa inner membrane insertion protein  28.68 
 
 
557 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299868  normal  0.294876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  36.9 
 
 
548 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  34.73 
 
 
541 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  30.54 
 
 
565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.14 
 
 
536 aa  174  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>