277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2153 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2153  YD repeat protein  100 
 
 		 550 aa  1097    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0957707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.25 
 
 		 3027 aa  160  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  31.31 
 
 		 2942 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 2035 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1942 aa  124  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1959 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.26 
 
 		 2096 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1917 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1669 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.19 
 
 		 2277 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.32 
 
 		 2149 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1840 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.21 
 
 		 1489 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1352 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.63 
 
 		 1953 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 927 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.46 
 
 		 1271 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.78 
 
 		 1488 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.47 
 
 		 1560 aa  96.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1547 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1520 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1550 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 3689 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.76 
 
 		 1981 aa  95.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1602 aa  94.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1551 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.81 
 
 		 1485 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.21 
 
 		 1259 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1527 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  23.51 
 
 		 1579 aa  91.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1600 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  23.33 
 
 		 1428 aa  90.9  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  23.58 
 
 		 1679 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.45 
 
 		 1593 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  23.14 
 
 		 1673 aa  87.8  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.66 
 
 		 1518 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  21.93 
 
 		 1495 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  22.63 
 
 		 1379 aa  87  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.22 
 
 		 1429 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.62 
 
 		 1485 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.84 
 
 		 1576 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.31 
 
 		 1362 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  24.86 
 
 		 1388 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  22.99 
 
 		 1508 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.71 
 
 		 2731 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.05 
 
 		 1626 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.73 
 
 		 1528 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  23.35 
 
 		 1411 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1023 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.71 
 
 		 1614 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  23.35 
 
 		 1377 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.1 
 
 		 1528 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.53 
 
 		 1539 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.45 
 
 		 1609 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  23.28 
 
 		 613 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.92 
 
 		 2294 aa  84  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  25.13 
 
 		 1388 aa  83.6  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  25.13 
 
 		 1308 aa  83.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.77 
 
 		 1572 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 934 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.3 
 
 		 1539 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1554 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1377 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1654 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1586 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1411 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1397 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  23.35 
 
 		 1397 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  24.87 
 
 		 1411 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  23.35 
 
 		 1397 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  24.62 
 
 		 1397 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  23.35 
 
 		 1411 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  24.62 
 
 		 1365 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1405 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  24.31 
 
 		 1399 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  24.31 
 
 		 1394 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1531 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  24.31 
 
 		 1409 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.66 
 
 		 1568 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.47 
 
 		 1543 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1552 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  22.33 
 
 		 1434 aa  80.1  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.88 
 
 		 1530 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  26.4 
 
 		 1429 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1611 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  26.02 
 
 		 1426 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  26.02 
 
 		 1200 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1426 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.41 
 
 		 1348 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1216 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1426 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1699 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.72 
 
 		 1586 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1565 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1565 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  27.44 
 
 		 917 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 2003 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  23.94 
 
 		 2144 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  24.14 
 
 		 5189 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  23.06 
 
 		 924 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>