More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2731 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 497 aa  932    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.12 
 
 		 608 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 		 503 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  42.62 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  42 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  38.34 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  36.45 
 
 		 621 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  32.15 
 
 		 641 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 		 621 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  38.87 
 
 		 586 aa  163  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.02 
 
 		 586 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  41.08 
 
 		 587 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 		 541 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 509 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 634 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.4 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  38.93 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  32.7 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.12 
 
 		 382 aa  67  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  32.11 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  22.84 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  29.06 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  30.15 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  27.13 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  33.07 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  34.78 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  28.45 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  29.65 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  34.52 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  31.43 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.63 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  35.04 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.6 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  37.62 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  31.73 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  32.37 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.27 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  33.55 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  30.62 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  30.91 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  34.31 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  31.56 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  31.54 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  31.92 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  31.19 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  31.92 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  31.19 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  31.92 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1266  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000032302  hitchhiker  0.00027333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  32.39 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  28.54 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  32.39 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  31.08 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 		 468 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  31.19 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  28.09 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003356  multidrug resistance efflux pump  34.69 
 
 		 271 aa  57  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000276837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.23 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  37.78 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  30.17 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  35.61 
 
 		 334 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  36.15 
 
 		 405 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  30.22 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  32.3 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.65 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  32.23 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  35.46 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  36 
 
 		 343 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  29.02 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  40 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  29.45 
 
 		 403 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.65 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>