More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00900 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00900  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.554703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  48.75 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1534  Shikimate kinase  48.12 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  40.14 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  34.93 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  35.76 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  37.41 
 
 		 167 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  35 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 495 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  35.33 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  34.93 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  31.52 
 
 		 189 aa  84.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_002950  PG1593  shikimate kinase  30.49 
 
 		 186 aa  84  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  35.93 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  30.3 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  33.95 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  34.94 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  30.49 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  33.33 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  32.19 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  32.26 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  29.81 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  32.08 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12670  shikimate kinase  30.43 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.799504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  31.29 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  32.74 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  32.32 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  35.33 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  30.91 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  34.84 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  31.71 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  33.12 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  30.32 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  34.38 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  36.21 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  29.88 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  31.14 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  28.05 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  30.43 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  35.09 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  30.14 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  32.1 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2901  shikimate kinase  26.83 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  28.05 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  33.77 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  30.49 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  30.43 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  26.83 
 
 		 190 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  31.01 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  33.12 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  30.65 
 
 		 560 aa  71.6  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  31.82 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  31.25 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  29.88 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  31.76 
 
 		 591 aa  70.9  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  31.93 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  30 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  30.63 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  30.3 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  30.67 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  30.91 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  26.54 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  34.36 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  29.87 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  29.7 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  27.27 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  30.3 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  34.38 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  32.86 
 
 		 539 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  35.67 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  30 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  34.97 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  33.76 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  31.5 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  29.19 
 
 		 551 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  27.44 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  33.12 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  29.27 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  31.25 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  29.27 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  30.49 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  30 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  28.57 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0679  shikimate kinase  30.82 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  27.88 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  27.88 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  35.65 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  33.33 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  31.33 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  33.56 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  32.76 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  32.76 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  28.66 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  30.3 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  30.7 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  28.75 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  28.14 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  33.53 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  28.66 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>