156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0623 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0623  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5025  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8476  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4963  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.16936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9612  transcriptional regulatory protein  30.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350752  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2591  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  38.89 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.71 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  38.98 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  33.94 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  52 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  25.69 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  36.23 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  52.17 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4648  transcriptional regulator, GntR family  45.1 
 
 		 102 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  46 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  32.86 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4164  hypothetical protein  24.21 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>