More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8476 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8476  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5025  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9612  transcriptional regulatory protein  30.13 
 
 		 222 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350752  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4164  hypothetical protein  29.41 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.22 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4963  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.16936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0623  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  48.28 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  27.78 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  38.82 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  23.79 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2477  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  38.75 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.19 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  35.9 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  24.49 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  36.14 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  30.19 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  31.52 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  44.07 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  42.53 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.95 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>