18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4164 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4164  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5025  transcriptional regulator, GntR family  52.15 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8476  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  23.47 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2528  regulatory protein GntR, HTH  32.43 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 229 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9612  transcriptional regulatory protein  21.2 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>