More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2528 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2528  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2591  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5195  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  26.62 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5025  transcriptional regulator, GntR family  24.5 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1564  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  28.12 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 262 aa  52  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 251 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  32.77 
 
 		 252 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  32.08 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>