More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2591 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2591  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2528  regulatory protein GntR, HTH  41.71 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5195  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  43.02 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1983  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7795  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 241 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  37.65 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3337  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0218222  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.32 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  40.48 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  26.09 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  34.21 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 290 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 249 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  46.97 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  47.46 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 254 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 240 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9612  transcriptional regulatory protein  37.68 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350752  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3048  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.8 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>