More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7795 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7795  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7789  GntR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0274244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2389  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.183953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  33.13 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  28.92 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  28.84 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.2 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  29.48 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  48.61 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  27.22 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  30.82 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  44.05 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.16 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  37.36 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  24.41 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  27.17 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>