200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2389 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2389  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.183953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7789  GntR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0274244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7795  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  53.23 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  44 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  35.82 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  37.23 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15140  transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  42.25 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2591  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  38.36 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  53.19 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  31.58 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  39.77 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  40 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>