More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7789 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7789  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0274244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7795  GntR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2389  GntR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.183953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  46.75 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  28.91 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  25.13 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0834  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  37.5 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  34.29 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  25.12 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  46.99 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  26.25 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  24.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  48.33 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  30.12 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  47.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>