More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15140 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15140  transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  470  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2920  transcriptional regulator GntR  46.81 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.430067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18050  transcriptional regulator, GntR family  50.64 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4138  GntR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00689638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2284  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.43 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.88 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  33.49 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  21.62 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0752  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00012009  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  43.82 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  29.86 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2856  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2920  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.6 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  24.26 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  23.31 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  42.62 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  21.34 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  24.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  43.33 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  24.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.96 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>