More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4963 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4963  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 234 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.16936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8476  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9612  transcriptional regulatory protein  38.89 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5025  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  25.66 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  44.87 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  40.86 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  41.38 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0623  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  37.5 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4629  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.470716  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4615  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 254 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  23.19 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>