More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4629 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4629  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.470716  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4615  GntR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 254 aa  355  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0223  transcriptional regulator, GntR family  58.6 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0229  GntR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  24.4 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  27.4 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  32.62 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  33.08 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  26.71 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  35.19 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  28.57 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>