More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0229 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0229  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0223  transcriptional regulator, GntR family  86.61 
 
 		 233 aa  340  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4629  GntR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.470716  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4615  GntR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  28.84 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.26 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3081  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  22.61 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  27.36 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.62 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  32.64 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  27.65 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  35.71 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>