More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4040 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
350 aa  657    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  96 
 
 
350 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  96.57 
 
 
350 aa  617  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  38.74 
 
 
340 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  45.64 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 
353 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 
353 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 
374 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 
359 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 
340 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 
328 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 
337 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  32.44 
 
 
336 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  35.04 
 
 
337 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  34 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  38.87 
 
 
328 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 
347 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 
337 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
347 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 
328 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 
335 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 
353 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 
331 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 
317 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 
353 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 
330 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 
314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 
331 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 
441 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  39.27 
 
 
441 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 
440 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  39.27 
 
 
441 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 
342 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  34.1 
 
 
436 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  38.87 
 
 
441 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  33.9 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  28.45 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  31.14 
 
 
431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  28.9 
 
 
418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 
319 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 
319 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  27.86 
 
 
347 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  27.86 
 
 
347 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  27.86 
 
 
347 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0860  homoserine dehydrogenase  33.74 
 
 
438 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.017488  hitchhiker  0.0000000731878 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  27.57 
 
 
347 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  32.66 
 
 
445 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  30.06 
 
 
415 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  32.82 
 
 
428 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  31.5 
 
 
439 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  27.86 
 
 
346 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  27.86 
 
 
346 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  37.23 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  28.36 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  27.64 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  36.02 
 
 
440 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  32.28 
 
 
429 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  31.21 
 
 
439 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  31.88 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  36.02 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
432 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  32.27 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  28.24 
 
 
347 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  32.09 
 
 
440 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  35.23 
 
 
439 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  34.48 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  30.69 
 
 
440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  34.26 
 
 
437 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  33.08 
 
 
431 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  30.59 
 
 
430 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 
415 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  30.99 
 
 
428 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  33.05 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  33.06 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  31.85 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  33.88 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0164  homoserine dehydrogenase  29.28 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  39.1 
 
 
448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  32.91 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5333  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 
433 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.767379 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  32.95 
 
 
426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  32.95 
 
 
426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  32.58 
 
 
431 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  30.41 
 
 
433 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  34.2 
 
 
417 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 
438 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>