More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1274 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 439 aa  887    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  71.17 
 
 		 441 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  96.36 
 
 		 439 aa  857    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  77.63 
 
 		 436 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  99.54 
 
 		 439 aa  880    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  71.4 
 
 		 441 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  70.48 
 
 		 440 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  70.25 
 
 		 440 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  63.57 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  63.21 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  63.43 
 
 		 440 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  62.98 
 
 		 440 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  62.33 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  62.75 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  62.56 
 
 		 435 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  63.66 
 
 		 440 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  55.3 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  57.47 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  56.01 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  55.08 
 
 		 440 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  55.18 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  55.53 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  60 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  55.41 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  52.17 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  52.62 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  49.66 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  49.31 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  49.08 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  49.89 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  49.09 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  48.39 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  45.23 
 
 		 435 aa  359  5e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  44.27 
 
 		 436 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  43.92 
 
 		 436 aa  332  9e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 444 aa  329  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 443 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 415 aa  328  8e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  42.2 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  41.23 
 
 		 440 aa  325  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 442 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  42.39 
 
 		 439 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  43.79 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  45.23 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.13 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  44.31 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 		 427 aa  322  8e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0810  homoserine dehydrogenase  45.52 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0112934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.04 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  43.23 
 
 		 447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 434 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 442 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 463 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  40.99 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.91 
 
 		 440 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.36 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3015  homoserine dehydrogenase  45.16 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>