More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0843 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  76.48 
 
 		 439 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 437 aa  867    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  73.35 
 
 		 439 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  75.17 
 
 		 437 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  75.17 
 
 		 437 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  76.09 
 
 		 435 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  76.71 
 
 		 439 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  72.11 
 
 		 442 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  70.57 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  72.11 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  72.11 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  70.57 
 
 		 436 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  72.79 
 
 		 442 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  71.27 
 
 		 443 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  71.04 
 
 		 443 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  72.34 
 
 		 442 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  75.11 
 
 		 439 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  73.1 
 
 		 436 aa  611  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  70.59 
 
 		 443 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  69.89 
 
 		 436 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  71.2 
 
 		 442 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  68.74 
 
 		 436 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  70.11 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  68.42 
 
 		 438 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  67.51 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  67.51 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  71.66 
 
 		 442 aa  584  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  67.05 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  66.82 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  70.98 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  66.82 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  67.05 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  65.9 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  66.06 
 
 		 447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  66.37 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  66.36 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  65.15 
 
 		 448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  64.6 
 
 		 436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  69.04 
 
 		 436 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  65.38 
 
 		 440 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  65.9 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  70.67 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  63.82 
 
 		 433 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  63.86 
 
 		 452 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  67.21 
 
 		 437 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  62.95 
 
 		 449 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  65.67 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  69.57 
 
 		 438 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  65.05 
 
 		 449 aa  543  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  63.76 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  63.88 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  67.28 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  64.6 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  67.2 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  60.37 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  63.8 
 
 		 453 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  63.58 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  62.44 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  62.21 
 
 		 440 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  54.69 
 
 		 438 aa  488  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  56.18 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  56.12 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  55.9 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  51.38 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  52.63 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  47.95 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  47.02 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 		 436 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  46.22 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  45.64 
 
 		 436 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  47.47 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  46.98 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  45.75 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  46.76 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.68 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  45.31 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  47.71 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  49.19 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0011  homoserine dehydrogenase  48.31 
 
 		 466 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  45.77 
 
 		 435 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  46.76 
 
 		 441 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  45.27 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  46.49 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  46.75 
 
 		 431 aa  346  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  45.91 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>