More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1756 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 439 aa  890    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  50.34 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  48.86 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  49.32 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  49.43 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  49.66 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  46.67 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  48.63 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.21 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  48.28 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  48.28 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  48.09 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  46.95 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  47.18 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  47.18 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  46.79 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  47.06 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  45.75 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  44.62 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  46.83 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  46.83 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  47.45 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  49.32 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  46.83 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  46.83 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  46.94 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  46.83 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  48.52 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  47.18 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  47.83 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  45.75 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  47.83 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  46.38 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  47.95 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  47.6 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  48.22 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  47.84 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  47.6 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  48.22 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  45.49 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  46.73 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  45.87 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  49.05 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  46.7 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  45.29 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  46.47 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  49.87 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  49.41 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  43.15 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  47.49 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  50.26 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  50.26 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  47.36 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  50.26 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  50.26 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  50.26 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  50.26 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  50.26 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  46.92 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  48.52 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  47.6 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  49.74 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  49.2 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  47.61 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  47.03 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  49.07 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  47.72 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  48.05 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  46.59 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  45.64 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  46.49 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  46.7 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  44.99 
 
 		 445 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  45.27 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  48.4 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  49.08 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  49.09 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  44.99 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  44.99 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 435 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 		 436 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>