More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0882 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
427 aa  851    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  61.67 
 
 
430 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  63.73 
 
 
432 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  60.1 
 
 
435 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  61.92 
 
 
431 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  56.26 
 
 
432 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  55.42 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  51.41 
 
 
428 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  50.59 
 
 
428 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.17 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  48.69 
 
 
418 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  46.64 
 
 
436 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  45.94 
 
 
436 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 
440 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  51.98 
 
 
439 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  48.26 
 
 
432 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  48.26 
 
 
432 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  49.29 
 
 
429 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  47.03 
 
 
432 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  48.5 
 
 
445 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.39 
 
 
436 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
434 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  51.18 
 
 
427 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  50 
 
 
441 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  47.89 
 
 
431 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  47.89 
 
 
431 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  49.31 
 
 
436 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  47.89 
 
 
431 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  47.89 
 
 
431 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
439 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  47.89 
 
 
431 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  46.01 
 
 
431 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 
438 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  46.48 
 
 
431 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  47.39 
 
 
431 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  47.69 
 
 
433 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  47.64 
 
 
431 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  45.02 
 
 
424 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  46.3 
 
 
437 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42 
 
 
436 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  46.39 
 
 
448 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  47.91 
 
 
443 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  48.54 
 
 
427 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  50.12 
 
 
435 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  49.88 
 
 
431 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  50.35 
 
 
437 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  48.94 
 
 
430 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  45.95 
 
 
431 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  45.85 
 
 
437 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  45.85 
 
 
437 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  47.55 
 
 
442 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 
436 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  47.67 
 
 
443 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 
417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 
417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  46.88 
 
 
442 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 
447 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  46.64 
 
 
442 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  46.64 
 
 
442 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  46.32 
 
 
432 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  47.09 
 
 
442 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  43.47 
 
 
449 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  47.44 
 
 
443 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  47.65 
 
 
429 aa  358  9e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  44.96 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  46.62 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  46.85 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 
436 aa  356  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 
444 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  48.35 
 
 
430 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  45.75 
 
 
434 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  45.27 
 
 
439 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  45.75 
 
 
435 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  48.37 
 
 
438 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  45.6 
 
 
434 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  46.14 
 
 
463 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  48.11 
 
 
435 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  45.03 
 
 
439 aa  353  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  48.68 
 
 
436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  48.68 
 
 
440 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  44.22 
 
 
440 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  43.15 
 
 
438 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  44.77 
 
 
441 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  44.95 
 
 
433 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 
434 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  44.18 
 
 
469 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  45.63 
 
 
436 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  45.14 
 
 
438 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 
440 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  45.63 
 
 
436 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  45.14 
 
 
434 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 
431 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  47.92 
 
 
450 aa  349  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  45.6 
 
 
434 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  45.6 
 
 
434 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 
436 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  46.08 
 
 
434 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  43.29 
 
 
431 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>