More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0286 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  81.06 
 
 
432 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  81.52 
 
 
432 aa  710    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
433 aa  869    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  68.35 
 
 
434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  69.75 
 
 
429 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  69.28 
 
 
429 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  63.19 
 
 
469 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  64.19 
 
 
445 aa  545  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  55.05 
 
 
438 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  53.21 
 
 
438 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  56.12 
 
 
435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  52.63 
 
 
440 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  54.92 
 
 
435 aa  441  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  52.06 
 
 
438 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  49.08 
 
 
433 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  48.39 
 
 
433 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 
433 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 
433 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  47.69 
 
 
427 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.24 
 
 
432 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  46.17 
 
 
431 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 
430 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 
436 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  46.88 
 
 
418 aa  358  8e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  45.83 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  47.62 
 
 
432 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
439 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 
436 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 
436 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 
436 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.5 
 
 
436 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 
438 aa  342  9e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 
428 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 
432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 
431 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 
431 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 
431 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  46 
 
 
429 aa  335  7.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 
431 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 
431 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 
431 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 
431 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 
438 aa  333  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 
436 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  42 
 
 
431 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  41.77 
 
 
431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  45.5 
 
 
431 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  46.77 
 
 
427 aa  325  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
436 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  42.6 
 
 
440 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  42.52 
 
 
434 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.15 
 
 
437 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.15 
 
 
437 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 
440 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
463 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 
434 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  42.51 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 
438 aa  319  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 
424 aa  319  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 
433 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 
434 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 
437 aa  319  7.999999999999999e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 
434 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.52 
 
 
434 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.52 
 
 
434 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 
433 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 
437 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 
435 aa  317  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
434 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 
450 aa  315  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 
441 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  44.06 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 
448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 
441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 
427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.27 
 
 
431 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 
442 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 
442 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 
442 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 
432 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
437 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 
442 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40.51 
 
 
439 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 
438 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 
431 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 
442 aa  310  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 
442 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
443 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38.25 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 
437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  40.04 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>