More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0783 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  84.62 
 
 
429 aa  717    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
429 aa  862    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  71.53 
 
 
432 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  71.3 
 
 
432 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  67.51 
 
 
434 aa  617  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  69.75 
 
 
433 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  65.41 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  64.1 
 
 
445 aa  554  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  53.46 
 
 
438 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  52.06 
 
 
438 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  55.66 
 
 
435 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  51.15 
 
 
440 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  54.7 
 
 
435 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  50.91 
 
 
438 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  46.51 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  46.28 
 
 
433 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  46.28 
 
 
433 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 
433 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 
432 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.96 
 
 
427 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  44.99 
 
 
418 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 
428 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  46.73 
 
 
432 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  46.85 
 
 
431 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 
430 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 
436 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 
432 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 
428 aa  349  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 
436 aa  349  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  41.75 
 
 
431 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 
431 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  41.39 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  41.39 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  41.72 
 
 
435 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 
431 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 
438 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 
431 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 
431 aa  342  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 
431 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 
431 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  43.93 
 
 
429 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.14 
 
 
436 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 
431 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 
433 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 
433 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 
431 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  41.43 
 
 
431 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  41.45 
 
 
432 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 
463 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 
440 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 
438 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 
431 aa  329  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  43.23 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 
434 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 
435 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 
431 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
431 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 
434 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 
434 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 
437 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 
441 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 
427 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.98 
 
 
434 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 
434 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 
431 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.98 
 
 
434 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 
436 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
438 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 
440 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 
440 aa  322  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  43.63 
 
 
439 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 
436 aa  322  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  45.6 
 
 
438 aa  322  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 
437 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 
437 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 
437 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 
430 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 
429 aa  318  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 
430 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 
442 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>