More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2114 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
435 aa  877    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  64.27 
 
 
430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  60.1 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  60.48 
 
 
432 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  60.37 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  61.02 
 
 
431 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  54.12 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  52.22 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  49.42 
 
 
428 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  45.58 
 
 
436 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  46.51 
 
 
436 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  45.14 
 
 
432 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
436 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  46.3 
 
 
428 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  47.62 
 
 
429 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 
434 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  49.26 
 
 
427 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
436 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  46.4 
 
 
437 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  46.4 
 
 
437 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 
436 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 
435 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  45.5 
 
 
432 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 
448 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 
436 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  45.27 
 
 
432 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  46.58 
 
 
431 aa  363  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 
445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 
438 aa  362  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 
436 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 
431 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  45.71 
 
 
436 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 
431 aa  359  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 
431 aa  359  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 
431 aa  359  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 
431 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 
431 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 
431 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.55 
 
 
440 aa  359  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  44.22 
 
 
440 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  45.1 
 
 
443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 
439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 
436 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  45.1 
 
 
443 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 
442 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  44.85 
 
 
442 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 
427 aa  354  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  44.85 
 
 
442 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 
431 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  45.94 
 
 
437 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  45.82 
 
 
431 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 
432 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 
447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  45.22 
 
 
430 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  44.85 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 
424 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 
439 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 
433 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  45.22 
 
 
430 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 
434 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 
436 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  43.24 
 
 
431 aa  350  4e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  45.2 
 
 
439 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.85 
 
 
436 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 
441 aa  349  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 
435 aa  349  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 
442 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 
442 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 
437 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 
431 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 
443 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  40.17 
 
 
469 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  44.62 
 
 
437 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  44.73 
 
 
427 aa  346  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  41.95 
 
 
431 aa  346  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  44.26 
 
 
433 aa  345  7e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 
440 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  44.16 
 
 
442 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 
445 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  45.32 
 
 
417 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  45.32 
 
 
417 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 
431 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  46.84 
 
 
429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 
431 aa  342  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 
438 aa  342  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 
448 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 
448 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 
438 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  41.99 
 
 
431 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  43.85 
 
 
433 aa  342  9e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 
433 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  41.99 
 
 
431 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 
431 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>