More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0498 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  883    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  52.64 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.31 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 436 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 		 431 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.17 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  40.86 
 
 		 438 aa  347  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 439 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 423 aa  345  8e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 436 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  43.29 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  43.63 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  44.59 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  43.54 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 440 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  44.05 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.66 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.66 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  41.95 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  42.08 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.38 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 		 441 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  43.38 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  43.14 
 
 		 431 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.95 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 431 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.31 
 
 		 440 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  43.38 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.9 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 431 aa  326  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 427 aa  326  5e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  40.59 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 449 aa  325  7e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 447 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 		 439 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.86 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  43.76 
 
 		 420 aa  322  6e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  41.33 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  43 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  39.78 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  41.48 
 
 		 452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  39.41 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  41.27 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  41.04 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>