More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1929 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  872    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  67.91 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  58.93 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  57.68 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  57.35 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2314  homoserine dehydrogenase  51.65 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.848588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  45.92 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.67 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  45.77 
 
 		 441 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 427 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.07 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  41.33 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.73 
 
 		 432 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  40.79 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  40.51 
 
 		 427 aa  309  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 441 aa  309  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 433 aa  309  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.13 
 
 		 434 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  39.54 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  43.6 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.7 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 449 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 425 aa  300  5e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  40.64 
 
 		 440 aa  298  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  41.16 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  41.56 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  38.85 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 436 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 434 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 448 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 436 aa  292  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  38.86 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  38.85 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  37.77 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  38.62 
 
 		 442 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  37.95 
 
 		 444 aa  289  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.16 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  38.11 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  39.42 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 415 aa  286  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  38.6 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>