More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2731 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  72.94 
 
 		 436 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 429 aa  866    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  72.24 
 
 		 424 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  58.93 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  57.11 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2314  homoserine dehydrogenase  60.41 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.848588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  45.24 
 
 		 440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.54 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.39 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.9 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 		 438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  42.62 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 436 aa  329  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  46.7 
 
 		 441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.4 
 
 		 443 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  42.19 
 
 		 436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 442 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  43.27 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 430 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  40.51 
 
 		 436 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  45.45 
 
 		 437 aa  315  8e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  39.55 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  41.77 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 444 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  41.05 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 		 430 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  44.72 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  44.95 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 		 431 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 		 431 aa  302  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 		 441 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 		 441 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  44.71 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.1 
 
 		 434 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  40.49 
 
 		 453 aa  299  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>