More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1412 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 436 aa  874    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  72.94 
 
 		 429 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  81.65 
 
 		 424 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  57.68 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  55.08 
 
 		 430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2314  homoserine dehydrogenase  61.28 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.848588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.45 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  42.62 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 436 aa  322  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  40.56 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  39.41 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 		 447 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 427 aa  318  9e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.69 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.61 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  44.26 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.93 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  42.45 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  42.45 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  43.2 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  43.6 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 436 aa  309  6.999999999999999e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  40.94 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  44.16 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  44.16 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 429 aa  302  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 463 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  39.03 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5333  homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.767379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44 
 
 		 436 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.41 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  41.65 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 438 aa  296  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  42.57 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 437 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1904  homoserine dehydrogenase  41.23 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  41.43 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 434 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  43.37 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  42.19 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 441 aa  289  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  41.96 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 		 441 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  43.08 
 
 		 440 aa  289  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 442 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>