More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5219 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  74.39 
 
 		 436 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  75.06 
 
 		 436 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  79.91 
 
 		 448 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  74.39 
 
 		 436 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  79.78 
 
 		 438 aa  697    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 449 aa  892    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  86 
 
 		 453 aa  748    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  78.95 
 
 		 452 aa  705    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  81.25 
 
 		 447 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  75.95 
 
 		 436 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  81.51 
 
 		 440 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  83.52 
 
 		 444 aa  748    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  86 
 
 		 453 aa  747    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  79.51 
 
 		 444 aa  684    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  73.23 
 
 		 439 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  72.79 
 
 		 439 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  69.03 
 
 		 443 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  67.92 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 443 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  68.36 
 
 		 442 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  68.75 
 
 		 435 aa  609  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  70.8 
 
 		 439 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  67.7 
 
 		 442 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  67.7 
 
 		 442 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  65.92 
 
 		 439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  69.93 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  70.29 
 
 		 438 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  67.92 
 
 		 442 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  68.14 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  64.59 
 
 		 437 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  64.59 
 
 		 437 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  60.13 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  60.36 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  59.91 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  59.91 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  59.91 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  59.91 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  60.58 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  59.65 
 
 		 434 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  59.65 
 
 		 434 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  59.47 
 
 		 463 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  62.95 
 
 		 437 aa  525  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  57.33 
 
 		 440 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  59.47 
 
 		 439 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  55.78 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  60.36 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  60.04 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  56.79 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  58.04 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  57.81 
 
 		 436 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  55.8 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  55.58 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  52.9 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  54.57 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  51.88 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  51.53 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  53.57 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  53.9 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  50.22 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  47.88 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  47.2 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  49.57 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  49.78 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  46.34 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  47.45 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.53 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  45.19 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  45.86 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0011  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  44.99 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  44.3 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.47 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  46.17 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  44.59 
 
 		 437 aa  355  6.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 428 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  47.64 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  43.64 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  49.62 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>