More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1218 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 440 aa  883    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  53.12 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  49.08 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  49.31 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  49.54 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  46.77 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  47.71 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  47 
 
 		 436 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  49.19 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  48.97 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  48.96 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  48.65 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  49.88 
 
 		 435 aa  415  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  46.79 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  49.32 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  48.16 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  48.16 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  48.97 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  48.97 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  47.95 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  49.32 
 
 		 443 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  47.94 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  49.54 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  47.95 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  48.52 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  48.76 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  48.19 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  47.36 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  47.27 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  45.58 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  50.97 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  48.29 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  48.86 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  47.52 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  46.34 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  49.08 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  49.1 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.62 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  46.9 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  48.87 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  46.9 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  46.67 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  46.45 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  47.69 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  47.91 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  48.41 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  46.08 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  46.08 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  48.09 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  46.31 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  47.46 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  46.56 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  48.04 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  47.83 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  46.56 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  48.16 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  47.82 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  47.85 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  50.13 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  50.12 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  46.31 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  45.92 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  45.54 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  45.92 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  45.62 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  47.47 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  45.24 
 
 		 429 aa  362  6e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  45.83 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 		 423 aa  356  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  45.28 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>