More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2479 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 431 aa  869    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  57.51 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  55.06 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  56.8 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  55.42 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  54.12 
 
 		 435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  55.53 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  49.88 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  49.88 
 
 		 431 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  48.95 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  48.95 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  48.71 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  48.48 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  48.71 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  48.71 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  48.71 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  48.71 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  47.87 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  47.78 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.88 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  47.78 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  48.4 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  48.27 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  45.14 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  48.5 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  44.91 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  47.63 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  47.64 
 
 		 418 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  45.28 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  45.28 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  47.61 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  45.28 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  45.05 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  45.05 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  45.28 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  46.33 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  45.05 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  45.67 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  45.05 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  46.62 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  46.4 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  46.17 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  48.66 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 440 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  45.77 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.55 
 
 		 442 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  46.03 
 
 		 429 aa  359  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  44.77 
 
 		 441 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 424 aa  358  9e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  43.52 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  45.81 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  43.99 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.99 
 
 		 443 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  44.25 
 
 		 469 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  43.08 
 
 		 443 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  45.74 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 463 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  47.09 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  44.73 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  46.85 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 448 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 434 aa  349  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 434 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  44.55 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  44.91 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  45.79 
 
 		 427 aa  346  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  43.6 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  46.48 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  43.6 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 449 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>