More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08020 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  850    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  58.45 
 
 
431 aa  474  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  53.5 
 
 
430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  53.86 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  49.76 
 
 
428 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 
431 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  50.59 
 
 
427 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  52.44 
 
 
431 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  51.57 
 
 
432 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  49.42 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  46.17 
 
 
436 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  48 
 
 
424 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  46.99 
 
 
433 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  45.27 
 
 
439 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 
440 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  46.53 
 
 
436 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  46.05 
 
 
436 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  46.93 
 
 
429 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  48.84 
 
 
418 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.95 
 
 
436 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
436 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 
436 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  45.85 
 
 
434 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 
438 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  43.95 
 
 
436 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  43.95 
 
 
432 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  45.87 
 
 
436 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 
432 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  46.76 
 
 
445 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 
440 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 
432 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 
463 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  47.36 
 
 
427 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 
434 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  44.68 
 
 
434 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 
434 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 
434 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 
434 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 
434 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 
434 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  45.16 
 
 
436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  45.81 
 
 
437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  45.64 
 
 
439 aa  361  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 
438 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  45.83 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 
434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 
431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 
442 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  45 
 
 
443 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  45 
 
 
443 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 
441 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 
437 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 
437 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 
447 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  45 
 
 
443 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 
441 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 
469 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 
442 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
442 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
442 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 
436 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 
431 aa  353  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  45.03 
 
 
436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 
449 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  44.77 
 
 
449 aa  352  7e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 
431 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 
431 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 
431 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 
436 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  44.77 
 
 
448 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 
431 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 
440 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 
429 aa  349  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
442 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 
444 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 
437 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
431 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
431 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 
431 aa  345  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
431 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 
441 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 
431 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
431 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 
436 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 
431 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 
432 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 
438 aa  342  8e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 
433 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 
435 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 
439 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 
431 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>