More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2410 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  843    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  61.07 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  60.27 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  57.14 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  55.09 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  53.88 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  52.62 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  54.04 
 
 		 433 aa  431  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  53.35 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  52.39 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  52.34 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  55.02 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  51.64 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  49.31 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  48.85 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  50.82 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  53.99 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  50.58 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  53.53 
 
 		 440 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  53.3 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  50.58 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  53.53 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  55.06 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  53.3 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  50.92 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  48.97 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  48.48 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  49.43 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  49.09 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  45.62 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  49.2 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  48.28 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  47.48 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.85 
 
 		 436 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0810  homoserine dehydrogenase  56.11 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0112934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  45.35 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  47.1 
 
 		 436 aa  352  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  45.87 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  48.04 
 
 		 449 aa  348  8e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  45.58 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  46.42 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  46.42 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 		 434 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  44.9 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  44.85 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  49.42 
 
 		 437 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  46.29 
 
 		 444 aa  342  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  45.58 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  45.93 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.99 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3015  homoserine dehydrogenase  50.37 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 		 448 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 438 aa  338  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.99 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 442 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  46.95 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  45.66 
 
 		 439 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 436 aa  328  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>