More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1387 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  78.16 
 
 		 435 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 433 aa  853    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  68.56 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  65.23 
 
 		 440 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  67.27 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  66.36 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  66.59 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  66.14 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  62.33 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  62.24 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  62.33 
 
 		 439 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  61.36 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  62.13 
 
 		 441 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  62.87 
 
 		 439 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  59.63 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  61.09 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  61.36 
 
 		 440 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  64.34 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  57.8 
 
 		 440 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  57.34 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  60.05 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  60.45 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  57.34 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  57.57 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  54.04 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  52.89 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  51.15 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  49.88 
 
 		 428 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  48.63 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  49.3 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  49.19 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  49.19 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  49.19 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  51.04 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  51.16 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  48.97 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  51.96 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.2 
 
 		 436 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  46.28 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  44.04 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  44.04 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  45.11 
 
 		 436 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  42.33 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 442 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.55 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  44.04 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.4 
 
 		 430 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  45.62 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3015  homoserine dehydrogenase  47.74 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 		 415 aa  312  9e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0810  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0112934 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  44.06 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1904  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.83 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 449 aa  309  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 442 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.73 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>