More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2998 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  846    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  74.53 
 
 
428 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  74.07 
 
 
428 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  74.07 
 
 
428 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  73.36 
 
 
428 aa  625  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  72.43 
 
 
428 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  69.72 
 
 
438 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  52.34 
 
 
430 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  50.92 
 
 
439 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 
439 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 
438 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  49.88 
 
 
433 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  50.35 
 
 
435 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  47.83 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  51.59 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  51.82 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  47.59 
 
 
441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  47.36 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  48.28 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 
436 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  50.91 
 
 
440 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  47.45 
 
 
437 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 
438 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  48.41 
 
 
440 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  48.49 
 
 
444 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  47.26 
 
 
440 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  47.72 
 
 
440 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  48.86 
 
 
440 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  48.52 
 
 
441 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  47.11 
 
 
435 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  46.91 
 
 
439 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  48.86 
 
 
439 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 
440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  47.26 
 
 
440 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  49.06 
 
 
428 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  47.32 
 
 
429 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 
439 aa  319  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 
436 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 
440 aa  306  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
436 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 
440 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 
463 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 
436 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 
427 aa  300  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.01 
 
 
436 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 
434 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 
433 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  39.45 
 
 
439 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 
428 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  39.4 
 
 
438 aa  295  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 
427 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  39.41 
 
 
436 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  40.92 
 
 
438 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 
436 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 
439 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 
436 aa  293  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  39.36 
 
 
433 aa  292  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 
436 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 
434 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 
444 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 
442 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 
442 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 
443 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 
443 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
420 aa  290  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0810  homoserine dehydrogenase  47.25 
 
 
444 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0112934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 
436 aa  289  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3015  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 
429 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 
439 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 
442 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 
434 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.59 
 
 
436 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  40.79 
 
 
449 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  40.2 
 
 
431 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 
429 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 
443 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 
435 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 
437 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
440 aa  286  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
436 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  36.77 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37 
 
 
431 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37 
 
 
431 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37 
 
 
431 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 
448 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>